More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2208 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  100 
 
 		 265 aa  546  1e-154  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  59.32 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  59.32 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  59.32 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  59.32 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  59.32 
 
 		 268 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  59.54 
 
 		 281 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  60.08 
 
 		 269 aa  315  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  57.25 
 
 		 268 aa  311  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  57.98 
 
 		 270 aa  309  2.9999999999999997e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  55.89 
 
 		 269 aa  286  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  58.05 
 
 		 243 aa  286  2.9999999999999996e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03985  transposase (IS4 family)  57.89 
 
 		 213 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  38.28 
 
 		 278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  38.13 
 
 		 276 aa  160  3e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  36.11 
 
 		 278 aa  159  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6839  transposase IS4 family protein  46.33 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  36.92 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  36.92 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  35.91 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  35.52 
 
 		 268 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  36.51 
 
 		 274 aa  149  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  34.62 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  33.98 
 
 		 275 aa  145  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  34.7 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  36.25 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  38.06 
 
 		 275 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  37.73 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  37.73 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  37.73 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  34.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  34.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  34.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  34.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  34.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  34.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  34.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  34.75 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  37.13 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  33.45 
 
 		 280 aa  139  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  35.02 
 
 		 275 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  31.76 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2723  transposase  34.62 
 
 		 278 aa  135  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  34.23 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  34.23 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  34.23 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  34.23 
 
 		 274 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  34.75 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  34.53 
 
 		 294 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  34.23 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  34.23 
 
 		 274 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1708  transposase IS4 family protein  34.04 
 
 		 273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  34.32 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  33.72 
 
 		 283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  30.8 
 
 		 266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  33.46 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  32.52 
 
 		 271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0095  transposase, IS4 family protein  31.18 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2037  transposase, IS4  34.21 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.362395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2540  transposase, IS4  34.21 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2707  transposase, IS4  34.21 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4006  transposase, IS4  34.21 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>