More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03985 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03985  transposase (IS4 family)  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  97.18 
 
 
243 aa  427  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  83.1 
 
 
268 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  83.1 
 
 
268 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  83.1 
 
 
268 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  83.1 
 
 
268 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  83.1 
 
 
268 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  79.81 
 
 
281 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  78.87 
 
 
268 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  76.35 
 
 
270 aa  338  4e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  65.87 
 
 
269 aa  292  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  57.89 
 
 
265 aa  254  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  57.89 
 
 
265 aa  254  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  57.89 
 
 
265 aa  254  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  57.89 
 
 
265 aa  254  9e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  57.28 
 
 
269 aa  246  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6839  transposase IS4 family protein  60.47 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
295 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
295 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  37.14 
 
 
295 aa  131  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  39.68 
 
 
308 aa  130  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  40.31 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  36.95 
 
 
278 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  33.99 
 
 
268 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  38.54 
 
 
278 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  34.98 
 
 
268 aa  122  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
266 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  33.48 
 
 
294 aa  121  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  33.04 
 
 
271 aa  119  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  31.96 
 
 
280 aa  118  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5099  IS4 family transposase  38.59 
 
 
224 aa  118  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.402428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  38.59 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  38.59 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  38.59 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  38.59 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  38.59 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  38.59 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  38.59 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  38.59 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  34.12 
 
 
251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  34.78 
 
 
274 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  34.78 
 
 
274 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  34.78 
 
 
274 aa  116  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  34.76 
 
 
274 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  35.83 
 
 
275 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  34.78 
 
 
274 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  34.78 
 
 
274 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  33.65 
 
 
254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3747  transposase IS4 family protein  34.65 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  34.3 
 
 
274 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  38.04 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  34.63 
 
 
270 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4990  IS4 family transposase  34.01 
 
 
273 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4899  IS4 family transposase  34.01 
 
 
273 aa  112  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.134652  normal  0.305485 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  35.6 
 
 
275 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  34.41 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  33.82 
 
 
274 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
284 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 
284 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  34.78 
 
 
280 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  35.89 
 
 
279 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  35.33 
 
 
270 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  35.33 
 
 
270 aa  111  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  34.78 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4363  transposase IS4 family protein  37.43 
 
 
283 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4179  transposase, IS4 family protein  34.62 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>