More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4955 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4955  transposase IS4 family protein  100 
 
 
281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219143  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  84.7 
 
 
268 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  84.7 
 
 
268 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  84.7 
 
 
268 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  84.7 
 
 
268 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  84.7 
 
 
268 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  83.9 
 
 
268 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  79.22 
 
 
270 aa  431  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  80.66 
 
 
243 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03985  transposase (IS4 family)  79.81 
 
 
213 aa  362  4e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  63.42 
 
 
269 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  59.54 
 
 
265 aa  322  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  59.54 
 
 
265 aa  322  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  59.54 
 
 
265 aa  322  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  59.54 
 
 
265 aa  322  4e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2925  transposase IS4 family protein  57.74 
 
 
269 aa  315  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6839  transposase IS4 family protein  68.33 
 
 
274 aa  247  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.919057  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  35.55 
 
 
268 aa  168  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  35.55 
 
 
268 aa  165  8e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6779  transposase IS4 family protein  37.82 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3385  transposase, IS4  38.02 
 
 
308 aa  161  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.300712 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  38.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0208  ISRSO1-transposase protein  37.02 
 
 
274 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3351  transposase  37.02 
 
 
274 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0127  ISRSO1 transposase protein  37.02 
 
 
274 aa  159  6e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00111919  normal  0.542312 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1302  ISRSO1-transposase protein  37.02 
 
 
274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1332  ISRSO1-transposase protein  37.02 
 
 
274 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4898  IS4 family transposase  36.05 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0763576  normal  0.401338 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4900  IS4 family transposase  36.05 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.413324  normal  0.183223 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5050  IS4 family transposase  36.05 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.954495  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2168  IS4 family transposase  36.05 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171514  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2410  IS4 family transposase  36.05 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2649  IS4 family transposase  36.05 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4415  IS4 family transposase  36.05 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22437  normal  0.800845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4454  IS4 family transposase  36.05 
 
 
270 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.943978  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3199  transposase  36.64 
 
 
274 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0486502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  36.71 
 
 
274 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1009  ISRSO1-transposase protein  37.5 
 
 
274 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.11795  normal  0.296125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3221  transposase  37.02 
 
 
280 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000851994 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0837  hypothetical protein  80.95 
 
 
163 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00815342 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  36.72 
 
 
276 aa  152  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2808  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
284 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2795  transposase IS4 family protein  38.11 
 
 
284 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.319972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3262  transposase IS4 family protein  37.74 
 
 
279 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  35.74 
 
 
274 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1068  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000319943  unclonable  0.000000000131837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2136  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.378741  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  32.42 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  35.02 
 
 
265 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6909  transposase IS4 family protein  36.11 
 
 
278 aa  148  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3790  transposase IS4 family protein  37.71 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.135466  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0055  transposase IS4 family protein  37.71 
 
 
270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7602  transposase IS4 family protein  34.76 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0954844  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  34.98 
 
 
275 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  34.9 
 
 
274 aa  146  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2728  transposase IS5 family protein  34.77 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.264364  normal  0.61764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0935  transposase IS5 family protein  34.77 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.799188  normal  0.508265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2695  transposase IS5 family protein  34.77 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2712  transposase IS5 family protein  34.77 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678901  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1755  transposase IS5 family protein  34.77 
 
 
274 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0831197  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1766  transposase IS5 family protein  34.77 
 
 
274 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0743046  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1783  transposase IS5 family protein  34.77 
 
 
274 aa  145  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  32.97 
 
 
295 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  34.77 
 
 
251 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  34.77 
 
 
251 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  34.77 
 
 
251 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  34.77 
 
 
251 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  34.77 
 
 
251 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>