More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1311 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  556  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.06 
 
 
271 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58374  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.8 
 
 
286 aa  353  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0952  peptide ABC transporter, permease protein  63.08 
 
 
286 aa  349  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1010  peptide ABC transporter, permease protein  62.37 
 
 
286 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.67 
 
 
274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.566812  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.45 
 
 
270 aa  322  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.727707  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.85 
 
 
297 aa  275  9e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26300  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  52.43 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5643  ABC transporter  51.97 
 
 
288 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00533049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6475  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  59.71 
 
 
294 aa  264  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0575522  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.38 
 
 
295 aa  263  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.24 
 
 
291 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.43 
 
 
307 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.73 
 
 
286 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.88 
 
 
290 aa  245  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  50.19 
 
 
867 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.56 
 
 
291 aa  237  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.56 
 
 
291 aa  237  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.76 
 
 
287 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  48.3 
 
 
321 aa  228  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.26 
 
 
293 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  45.02 
 
 
299 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.26 
 
 
293 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  45.02 
 
 
299 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  45.02 
 
 
299 aa  226  3e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  45.02 
 
 
299 aa  226  3e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
287 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  45.02 
 
 
299 aa  226  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
313 aa  225  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.96 
 
 
359 aa  225  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  42.91 
 
 
279 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  44.36 
 
 
282 aa  223  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.11 
 
 
301 aa  223  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
301 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.5 
 
 
294 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.431042  normal  0.667573 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.46 
 
 
277 aa  219  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 
299 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
303 aa  217  2e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
299 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  46.09 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  45.45 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  45.45 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.09 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  45.45 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  45.45 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  45.45 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  46.09 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  46.09 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.37 
 
 
272 aa  216  4e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.105201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  46.09 
 
 
303 aa  216  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  45.7 
 
 
303 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.7 
 
 
303 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  45.7 
 
 
303 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.25 
 
 
294 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.31 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.614915  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.89 
 
 
304 aa  215  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  45.05 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  45.7 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.96 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.55 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  44.73 
 
 
300 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2594  oligopeptide ABC transporter, permease protein  47.69 
 
 
285 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.73 
 
 
300 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
296 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
309 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  40.74 
 
 
284 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  43.2 
 
 
300 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  43.17 
 
 
302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.68 
 
 
307 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  43.17 
 
 
302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.11 
 
 
296 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  43.17 
 
 
302 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  43.22 
 
 
301 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  43.48 
 
 
302 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
299 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  45.68 
 
 
300 aa  205  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.52 
 
 
301 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.85 
 
 
299 aa  205  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.71 
 
 
301 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  44.36 
 
 
276 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.83 
 
 
299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 
284 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.83 
 
 
299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
359 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
295 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.83 
 
 
299 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101748  normal  0.208268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
280 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  45.87 
 
 
301 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  43.92 
 
 
303 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
297 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
297 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  41.55 
 
 
299 aa  202  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
310 aa  202  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
297 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
300 aa  202  7e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0620007  normal  0.517219 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>