More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4489 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.29 
 
 
286 aa  512  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5643  ABC transporter  73.29 
 
 
288 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00533049  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0952  peptide ABC transporter, permease protein  53.38 
 
 
286 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1010  peptide ABC transporter, permease protein  53.38 
 
 
286 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.38 
 
 
286 aa  267  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.53 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58374  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.28 
 
 
274 aa  226  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.566812  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.9 
 
 
287 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26300  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  46.79 
 
 
293 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.87 
 
 
297 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  42.09 
 
 
299 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  42.09 
 
 
299 aa  214  9e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  42.09 
 
 
299 aa  214  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  42.09 
 
 
299 aa  214  9e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  42.09 
 
 
299 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.52 
 
 
270 aa  214  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.727707  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6475  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  51.66 
 
 
294 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0575522  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  40.58 
 
 
301 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.76 
 
 
300 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.33 
 
 
290 aa  202  6e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
867 aa  201  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.18 
 
 
294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.5 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  43.27 
 
 
299 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
301 aa  196  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.29 
 
 
295 aa  195  6e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  40.3 
 
 
303 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5291  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  43.8 
 
 
282 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
287 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.55 
 
 
303 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
297 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.26 
 
 
300 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
303 aa  193  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
296 aa  193  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.19 
 
 
359 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
297 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
297 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
303 aa  192  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0433  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
262 aa  192  4e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.93 
 
 
303 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.93 
 
 
303 aa  192  5e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.93 
 
 
303 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.93 
 
 
303 aa  192  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.55 
 
 
303 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
303 aa  192  7e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
310 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.58 
 
 
293 aa  192  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  39.55 
 
 
303 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.06 
 
 
321 aa  191  8e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
301 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.08 
 
 
313 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
302 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  41.09 
 
 
302 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  41.09 
 
 
302 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
302 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  39.93 
 
 
297 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
301 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
302 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
302 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  41.09 
 
 
302 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.67 
 
 
307 aa  189  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.24 
 
 
291 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
290 aa  189  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.118139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.15 
 
 
293 aa  189  5e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
272 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.874851  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
294 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.3 
 
 
299 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
273 aa  187  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  37.83 
 
 
279 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
304 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.581816  normal  0.108458 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
296 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
297 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
291 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
297 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
299 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
299 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5949  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
275 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
280 aa  185  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
286 aa  185  9e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.68 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  38.87 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  38.87 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6640  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
272 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.50093  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  38.87 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  38.87 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.431042  normal  0.667573 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.47 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  38.87 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.14 
 
 
279 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0684403  hitchhiker  0.00159675 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
294 aa  183  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00097283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.02 
 
 
309 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  41.56 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.81 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  40.56 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>