More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0778 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0778  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
274 aa  534  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.566812  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.29 
 
 
271 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.58374  normal  0.490957 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  72.18 
 
 
270 aa  348  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.727707  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.68 
 
 
286 aa  315  6e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.304956  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0952  peptide ABC transporter, permease protein  58.05 
 
 
286 aa  314  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1010  peptide ABC transporter, permease protein  57.68 
 
 
286 aa  308  8e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.67 
 
 
287 aa  305  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26300  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  50 
 
 
293 aa  258  6e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.131884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6475  putative oligopeptide ABC transporter (permease protein)  55.43 
 
 
294 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0575522  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5643  ABC transporter  49.6 
 
 
288 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00533049  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.62 
 
 
286 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.87 
 
 
290 aa  234  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.62 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.82 
 
 
295 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  43.89 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  43.89 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  43.89 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  43.89 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  43.89 
 
 
299 aa  228  8e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.07 
 
 
291 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.44 
 
 
291 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.02 
 
 
307 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.44 
 
 
291 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.688141  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.96 
 
 
287 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  45.49 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
309 aa  207  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
299 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  43.94 
 
 
867 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  43.17 
 
 
321 aa  205  8e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
359 aa  204  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
287 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
294 aa  203  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.96 
 
 
300 aa  202  5e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.765267  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.33 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.28 
 
 
277 aa  199  3e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.7 
 
 
296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.53 
 
 
294 aa  199  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.07 
 
 
303 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
296 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 
296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.42 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
294 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.431042  normal  0.667573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  42.05 
 
 
279 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0389  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
272 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.105201  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  40.81 
 
 
297 aa  193  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
301 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2849  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
304 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
293 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
297 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
297 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
304 aa  192  7e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.68 
 
 
289 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.51 
 
 
293 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
299 aa  191  8e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.07 
 
 
303 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
301 aa  191  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
297 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
298 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.21 
 
 
285 aa  191  1e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
297 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4165  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
297 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723958 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
297 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 
301 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.03 
 
 
301 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  42.91 
 
 
276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
295 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2959  ABC transporter related  43.72 
 
 
599 aa  188  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
272 aa  188  9e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.874851  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
298 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2793  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.47 
 
 
285 aa  187  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.614915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
299 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
299 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101748  normal  0.208268 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.92 
 
 
291 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
299 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.404542 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  38.6 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2771  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.01 
 
 
288 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  38.6 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
303 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  42.39 
 
 
301 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
310 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  41.24 
 
 
317 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  38.6 
 
 
302 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  41.73 
 
 
282 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
284 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.399737 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.85 
 
 
303 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.85 
 
 
303 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.85 
 
 
303 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  39.85 
 
 
303 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.98 
 
 
303 aa  186  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.551804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  39.48 
 
 
303 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.48 
 
 
303 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  40 
 
 
299 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  39.48 
 
 
303 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>