39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1804 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 122 aa  246  1e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  69.67 
 
 		 121 aa  168  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  70.43 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  68.97 
 
 		 117 aa  160  6e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  64.66 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  57.39 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  54.78 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  58.26 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  52.59 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  50.86 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  52.59 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  50.86 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  50.41 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  50 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  52.63 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 		 120 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  41.32 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  38.84 
 
 		 122 aa  93.6  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  38.84 
 
 		 122 aa  93.2  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  38.02 
 
 		 122 aa  89.7  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  40.16 
 
 		 120 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  40.71 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  38.04 
 
 		 117 aa  73.6  0.0000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  37.23 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  32.35 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  29.66 
 
 		 192 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  32.5 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  28.23 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17321  50S ribosomal protein L15  30.77 
 
 		 152 aa  42.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  31.87 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  30.51 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  32.61 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1309  50S ribosomal protein L15  30.77 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17481  50S ribosomal protein L15  28.21 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1464  50S ribosomal protein L15  35.63 
 
 		 144 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000860578  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0200  50S ribosomal protein L15  33.94 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.205924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>