32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1970 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 
122 aa  230  4.0000000000000004e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  83.61 
 
 
122 aa  204  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  82.79 
 
 
122 aa  199  9e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  79.51 
 
 
122 aa  194  3e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  61.06 
 
 
119 aa  134  5e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  46.9 
 
 
120 aa  101  4e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  47.79 
 
 
117 aa  96.7  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  41.59 
 
 
120 aa  95.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  45.3 
 
 
120 aa  94.7  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  41.32 
 
 
120 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  41.32 
 
 
120 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  41.32 
 
 
120 aa  94  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 
120 aa  94  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  38.05 
 
 
121 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  38.94 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  40.71 
 
 
117 aa  90.1  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  38.02 
 
 
122 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  38.79 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  38.94 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  38.94 
 
 
121 aa  86.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  41.59 
 
 
116 aa  84.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  40.71 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  36.45 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  39.66 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  37.93 
 
 
117 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  37.07 
 
 
117 aa  80.9  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  41 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  37.38 
 
 
117 aa  70.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  32.71 
 
 
190 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4007  50S ribosomal protein L15  31.58 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000722661  hitchhiker  0.0000691431 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1166  50S ribosomal protein L15  32.89 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000441483  normal  0.095301 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  31.13 
 
 
184 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>