15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33583 on replicon NC_009363
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  62.5 
 
 
192 aa  227  9e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  64.37 
 
 
184 aa  217  7.999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  60.64 
 
 
190 aa  215  4e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85665  predicted protein  55.08 
 
 
186 aa  199  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251069  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  31.45 
 
 
121 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  27.27 
 
 
117 aa  52  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  30.53 
 
 
121 aa  51.2  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  26.92 
 
 
121 aa  48.1  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  27.91 
 
 
126 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  28.23 
 
 
122 aa  44.7  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  28.69 
 
 
120 aa  44.7  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  31.33 
 
 
115 aa  42.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  31.52 
 
 
139 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  26.89 
 
 
117 aa  41.6  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>