32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2384 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 121 aa  243  4.9999999999999997e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  71.07 
 
 		 121 aa  173  6e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  70.43 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  64.46 
 
 		 121 aa  159  8.000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  66.67 
 
 		 117 aa  154  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  56.03 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  55.17 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  55.56 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  54.78 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  56.14 
 
 		 117 aa  125  3e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  53.1 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  52.17 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  52.17 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  50.43 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  50.43 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  50.43 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  53.04 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  50.43 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  47.86 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  41.53 
 
 		 120 aa  90.5  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  40.71 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  40.71 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  38.94 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  38.94 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  37.93 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  34.48 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  37.66 
 
 		 117 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  30.97 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  30.58 
 
 		 192 aa  53.5  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.53 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  28.46 
 
 		 190 aa  41.2  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  29.73 
 
 		 184 aa  40  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>