32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1051 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  60.17 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  43.44 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  40.98 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  47.57 
 
 		 120 aa  90.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  50 
 
 		 119 aa  88.2  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  44.26 
 
 		 120 aa  83.6  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  39.62 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  38.02 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  43.88 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  37.19 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  37.19 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  37.19 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  36.36 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  36.44 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  37.23 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  38.79 
 
 		 116 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  40.37 
 
 		 115 aa  72  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  41 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  34.48 
 
 		 121 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  34.48 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  37.39 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  34.75 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  34.75 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  35.83 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  32.76 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  36.79 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  35 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01350  ribosomal protein L15  34.69 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.053024  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2046  50S ribosomal protein L15  27.5 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00109939  hitchhiker  0.00499701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0308  50S ribosomal protein L15  29.52 
 
 		 184 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0135677  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  42.86 
 
 		 184 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>