28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2098 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 122 aa  233  6e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  84.43 
 
 		 122 aa  206  7e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  82.79 
 
 		 122 aa  199  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  79.51 
 
 		 122 aa  197  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  60.18 
 
 		 119 aa  135  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  49.56 
 
 		 117 aa  100  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  44.63 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  46.15 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  44.63 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  44.63 
 
 		 120 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  41.38 
 
 		 120 aa  98.2  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  43.1 
 
 		 139 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  42.48 
 
 		 121 aa  97.4  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  41.32 
 
 		 122 aa  95.9  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  44.25 
 
 		 117 aa  96.3  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  45.13 
 
 		 120 aa  94.7  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  40.52 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  39.82 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  38.79 
 
 		 117 aa  89.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  39.82 
 
 		 116 aa  88.6  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  42.48 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  40.71 
 
 		 121 aa  87  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  37.93 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  36.21 
 
 		 117 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  32.73 
 
 		 115 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  35.29 
 
 		 117 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  34.75 
 
 		 119 aa  68.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>