30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1820 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 117 aa  236  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  81.74 
 
 		 115 aa  187  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  76.92 
 
 		 117 aa  186  9e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  78.26 
 
 		 116 aa  186  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  75.21 
 
 		 117 aa  181  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  53.91 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  54.78 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  52.59 
 
 		 122 aa  124  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  49.15 
 
 		 126 aa  120  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  49.14 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  50.43 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  48.7 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  47.83 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  46.61 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  44.25 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  46.02 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  44.25 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  44.25 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  43.36 
 
 		 120 aa  104  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  38.79 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  44.25 
 
 		 119 aa  88.6  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  37.93 
 
 		 122 aa  86.7  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  37.07 
 
 		 122 aa  86.7  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  37.93 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  34.51 
 
 		 115 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  43.48 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  36.79 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  30.51 
 
 		 184 aa  44.3  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  28.21 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>