29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0427 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
115 aa  233  8e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  42.11 
 
 
120 aa  97.1  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  40.71 
 
 
120 aa  93.2  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  40.2 
 
 
126 aa  90.5  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  40 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  36.84 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  36.84 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  36.84 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  37.27 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  35.96 
 
 
120 aa  84.3  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  34.51 
 
 
117 aa  84  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  36.45 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  34.55 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  32.73 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  47.67 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  35.92 
 
 
117 aa  77  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  36.89 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  34.51 
 
 
117 aa  75.1  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  35.45 
 
 
119 aa  75.1  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  38.83 
 
 
120 aa  74.7  0.0000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  36.27 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  35.4 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  33.33 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  40.37 
 
 
119 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  31.86 
 
 
116 aa  70.1  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  30.97 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  33.33 
 
 
117 aa  64.7  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  32.35 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  31.33 
 
 
186 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>