28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2144 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 117 aa  235  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  60.17 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  43.33 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  44.04 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  47.67 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  42.2 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  42.2 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  42.2 
 
 		 120 aa  87.8  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  38.53 
 
 		 120 aa  84.3  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  43.33 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  40.62 
 
 		 117 aa  80.5  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  47.67 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  46.75 
 
 		 120 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  41.67 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  41.56 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  42.11 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  43.48 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  38.04 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  37.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  37.38 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  41.3 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  35.29 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  33.65 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  32.76 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  37.66 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  39.13 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  34.34 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>