33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0270 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 120 aa  235  2e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 120 aa  235  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  100 
 
 		 120 aa  235  2e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  85 
 
 		 120 aa  208  2e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  60.83 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  56.3 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  55.26 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  53.98 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  50.43 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 		 121 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  48.31 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 		 117 aa  120  7e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  49.56 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  49.58 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0279  50S ribosomal protein L18e  47.97 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0424  ribosomal protein L15  44.25 
 
 		 117 aa  110  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  45.13 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  44.25 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2520  50S ribosomal protein L18e  44.25 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.37229  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2593  ribosomal protein L15  44.25 
 
 		 115 aa  103  9e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.470627  normal  0.0946075 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2098  50S ribosomal protein L18e  44.63 
 
 		 122 aa  99.4  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0696  50S ribosomal protein L18e  42.15 
 
 		 122 aa  98.2  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0362291  normal  0.101034 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  44.74 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2328  50S ribosomal protein L18e  43.8 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  unclonable  0.00000000613044  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  41.32 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2144  50S ribosomal protein L18e  42.2 
 
 		 117 aa  87.8  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000147154  hitchhiker  0.000302523 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0427  50S ribosomal protein L15  36.84 
 
 		 115 aa  85.1  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0179174 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1051  ribosomal protein L15  37.19 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128045  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  28 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16611  50S ribosomal protein L15  50 
 
 		 155 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.948391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23201  50S ribosomal protein L15  52.78 
 
 		 185 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2995  50S ribosomal protein L15  34.78 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  27.13 
 
 		 186 aa  40.4  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>