22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_30315 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  100 
 
 		 192 aa  394  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  62.5 
 
 		 186 aa  227  9e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  54.59 
 
 		 190 aa  193  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  58.25 
 
 		 184 aa  188  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85665  predicted protein  53.51 
 
 		 186 aa  181  8.000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  31.62 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  31.71 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  31.36 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  30.58 
 
 		 121 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  29.06 
 
 		 117 aa  53.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  27.42 
 
 		 120 aa  52.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0270  50S ribosomal protein L18e  28 
 
 		 120 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0568  50S ribosomal protein L18e  28 
 
 		 120 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.392216 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1350  50S ribosomal protein L18e  28 
 
 		 120 aa  51.2  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  29.66 
 
 		 122 aa  48.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  27.69 
 
 		 139 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  26.96 
 
 		 119 aa  47.8  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0634  50S ribosomal protein L18e  24.39 
 
 		 120 aa  47.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  26.67 
 
 		 126 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2550  ribosomal protein L15  29.06 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1820  50S ribosomal protein L18e  28.21 
 
 		 117 aa  42.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.736031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  25.86 
 
 		 117 aa  42  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>