17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03460 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03460  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  379  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05800  60S ribosomal protein L18 (AFU_orthologue; AFUA_2G07380)  68.28 
 
 		 184 aa  233  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000000000048674 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33583  Ribosomal protein L18, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  60.64 
 
 		 186 aa  215  4e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07665  normal  0.0789022 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85665  predicted protein  58.82 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.251069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30315  predicted protein  54.59 
 
 		 192 aa  193  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1243  50S ribosomal protein L18e  31.67 
 
 		 117 aa  54.3  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00120482  normal  0.935421 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1474  ribosomal protein L15  28.57 
 
 		 117 aa  51.2  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1097  50S ribosomal protein L18e  30.58 
 
 		 120 aa  49.3  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2898  50S ribosomal protein L18e  30 
 
 		 121 aa  49.3  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0383384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2388  50S ribosomal protein L18e  29.6 
 
 		 126 aa  48.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000260297  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2221  50S ribosomal protein L18e  31.67 
 
 		 121 aa  47.8  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1804  50S ribosomal protein L18e  32.5 
 
 		 122 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.592555  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0483  50S ribosomal protein L18e  26.83 
 
 		 120 aa  45.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0723  ribosomal protein L15  29.82 
 
 		 119 aa  45.1  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000571349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1428  50S ribosomal protein L18e  27.5 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0598114 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1970  50S ribosomal protein L18e  32.71 
 
 		 122 aa  42.4  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0059589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2384  50S ribosomal protein L18e  28.46 
 
 		 121 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000470692  normal  0.654463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>