264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1633 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1633  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 
189 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0991  glutamine amidotransferase class-I  47.31 
 
 
186 aa  170  9e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1351  glutamine amidotransferase class-I  40.11 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.885718  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1583  glutamine amidotransferase class-I  39.34 
 
 
189 aa  129  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1106  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 
179 aa  77.8  0.00000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0606  GMP synthase, small subunit  34.44 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  38.1 
 
 
525 aa  61.2  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2557  GMP synthase  37.27 
 
 
509 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2260  GMP synthase  36.36 
 
 
509 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0068  class I glutamine amidotransferase  24.6 
 
 
180 aa  58.5  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.919484 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1772  GMP synthase  41.44 
 
 
505 aa  58.2  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.564322  hitchhiker  0.00463456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1359  glutamine amidotransferase class-I  45.45 
 
 
247 aa  57.8  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0869  GMP synthase subunit A  32.8 
 
 
188 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143243  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0166  GMP synthase subunit A  35.43 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00906  GMP synthase  38.83 
 
 
521 aa  56.2  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00923984  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2002  GMP synthase subunit A  33.65 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.3362  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1228  GMP synthase subunit A  35.29 
 
 
189 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1588  GMP synthase  34.95 
 
 
522 aa  54.7  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1531  GMP synthase  34.95 
 
 
522 aa  53.9  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1553  anthranilate synthase component II  31.31 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000467195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0133  GMP synthase subunit A  32.77 
 
 
189 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.361551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0887  GMP synthase, large subunit  39.58 
 
 
510 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000175854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1588  GMP synthase subunit A  30.6 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0897  anthranilate synthase component II  36.44 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3038  GMP synthase, large subunit  39.67 
 
 
515 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.60036  hitchhiker  0.00129396 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0690  GMP synthase subunit A  37.86 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.635266  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1672  GMP synthase  35.64 
 
 
521 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.605377  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1723  GMP synthase  34.71 
 
 
505 aa  52.4  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.734167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  37.19 
 
 
516 aa  52  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1432  GMP synthase  33.33 
 
 
511 aa  51.6  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0118817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  35.58 
 
 
515 aa  51.2  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01077  GMP synthase  34.38 
 
 
517 aa  50.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1516  GMP synthase  31.74 
 
 
505 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0297  GMP synthase  33.33 
 
 
517 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  27.2 
 
 
511 aa  50.4  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0866  anthranilate synthase component II  38.54 
 
 
192 aa  50.1  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0738  GMP synthase  33.33 
 
 
517 aa  49.7  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1001  GMP synthase  34.85 
 
 
501 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  37.27 
 
 
513 aa  50.1  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  36.46 
 
 
510 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1303  GMP synthase  30.08 
 
 
525 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.222556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2287  GMP synthase  31.62 
 
 
536 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144923  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1196  GMP synthase  30.08 
 
 
525 aa  49.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000372416  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0408  GMP synthase  30.08 
 
 
525 aa  49.7  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000376888  decreased coverage  0.00000308048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2728  GMP synthase, large subunit  31.09 
 
 
525 aa  48.9  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.211488  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1784  GMP synthase  35.71 
 
 
510 aa  48.9  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0148865  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  31.53 
 
 
517 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0375  GMP synthase  35.42 
 
 
511 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216851  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  34.21 
 
 
522 aa  48.5  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1105  GMP synthase  34.09 
 
 
501 aa  48.5  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1504  glutamine amidotransferase class-I  31.29 
 
 
228 aa  48.9  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1912  GMP synthase, large subunit  27.54 
 
 
525 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1950  glutamine amidotransferase class-I  50 
 
 
205 aa  48.5  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.599214  normal  0.0313996 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.33 
 
 
517 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  35 
 
 
510 aa  48.5  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  34.43 
 
 
525 aa  48.5  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2895  GMP synthase, large subunit  32.31 
 
 
533 aa  48.5  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.131714 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  29.81 
 
 
519 aa  48.1  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1591  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  38 
 
 
185 aa  48.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.561043  hitchhiker  0.00968736 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0046  GMP synthase  29.32 
 
 
507 aa  48.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.214128  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0756  GMP synthase subunit A  29.41 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  33.33 
 
 
520 aa  47.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  33.33 
 
 
520 aa  47.8  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  33.33 
 
 
516 aa  47.8  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  32.69 
 
 
513 aa  47.8  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0912  GMP synthase  33.66 
 
 
520 aa  47.8  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00396953  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0515  GMP synthase  29.1 
 
 
512 aa  47.8  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1805  glutamine amidotransferase class-I  32 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.595238 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3627  glutamine amidotransferase class-I  28.78 
 
 
223 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3292  GMP synthase  34.91 
 
 
525 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2388  glutamine amidotransferase class-I  34.67 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0264  GMP synthase  34.38 
 
 
507 aa  47  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0879  glutamine amidotransferase class-I  32.88 
 
 
245 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4528  anthranilate synthase, component II  38.95 
 
 
187 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  31.78 
 
 
515 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1750  hypothetical protein  29.17 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1416  class I glutamine amidotransferase, putative  29.17 
 
 
200 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0610081  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1543  GMP synthase, large subunit  30.91 
 
 
507 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0967  GMP synthase  31.68 
 
 
520 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0246397  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0315  conserved hypothetical protein, putative glutamine amidotransferase  22.22 
 
 
199 aa  47  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2859  hypothetical protein  28.74 
 
 
230 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0919  GMP synthase subunit A  29.77 
 
 
189 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.956828 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  28.68 
 
 
517 aa  47  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0887  GMP synthase  27.59 
 
 
519 aa  47  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1708  GMP synthase  28.79 
 
 
527 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2429  GMP synthase  28.79 
 
 
527 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.357264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3595  GMP synthase  28.89 
 
 
525 aa  46.2  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0154182  normal  0.634347 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0938  anthranilate synthase component II  26.92 
 
 
188 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.644475  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0721  glutamine amidotransferase class-I  36.17 
 
 
238 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.706458  normal  0.650481 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02180  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  31.09 
 
 
544 aa  45.8  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0598  GMP synthase  36.27 
 
 
505 aa  45.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0421  GMP synthase  32.04 
 
 
523 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2712  glutamine amidotransferase class-I  31.48 
 
 
228 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0635027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2202  GMP synthase  34.38 
 
 
511 aa  46.2  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1762  glutamine amidotransferase  33.11 
 
 
250 aa  46.2  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0600  GMP synthase  32.45 
 
 
505 aa  46.2  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0760838  hitchhiker  0.0000221926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02020  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.73 
 
 
510 aa  46.2  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  30.64 
 
 
510 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  33.01 
 
 
560 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  34.34 
 
 
518 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>