24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1106 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1106  glutamine amidotransferase class-I  100 
 
 		 179 aa  354  5e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1351  glutamine amidotransferase class-I  33.88 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.885718  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0991  glutamine amidotransferase class-I  29.51 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.264354 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1633  glutamine amidotransferase class-I  33.16 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1583  glutamine amidotransferase class-I  27.54 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0638  GMP synthase  33.33 
 
 		 511 aa  49.3  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1385  GMP synthase  32.43 
 
 		 511 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0477  GMP synthase  34.23 
 
 		 511 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1264  GMP synthase  32.43 
 
 		 511 aa  44.7  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0502  carbamoyl-phosphate synthase, small subunit  28.12 
 
 		 365 aa  44.7  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.000000264253  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0940  GMP synthase  33.04 
 
 		 510 aa  44.7  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0568  anthranilate synthase component II  25.86 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  26.14 
 
 		 515 aa  42  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  34.78 
 
 		 510 aa  42  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0501  GMP synthase  32.43 
 
 		 511 aa  41.6  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0074  GMP synthase  29.06 
 
 		 526 aa  41.2  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003845  imidazole glycerol phosphate synthase amidotransferase subunit  28.66 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1617  GMP synthase  32.46 
 
 		 517 aa  40.8  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.322127  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1555  GMP synthase  31.36 
 
 		 510 aa  41.2  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1634  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  28.38 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.493457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2162  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH  28.38 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1619  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH  28.38 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.982785 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1209  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH  28.38 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2956  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisH  28.38 
 
 		 196 aa  40.8  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000115216 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>