More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2216 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2216  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
395 aa  801    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2379  phosphopyruvate hydratase  72.91 
 
 
395 aa  580  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00363465  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1809  phosphopyruvate hydratase  71.5 
 
 
395 aa  555  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1238  phosphopyruvate hydratase  65.66 
 
 
399 aa  533  1e-150  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0269963  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2893  phosphopyruvate hydratase  64.07 
 
 
402 aa  503  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00235502  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2545  enolase  60.35 
 
 
401 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0429  enolase  58.04 
 
 
403 aa  449  1e-125  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2598  phosphopyruvate hydratase  57.14 
 
 
401 aa  444  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2515  phosphopyruvate hydratase  55 
 
 
401 aa  432  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1825  phosphopyruvate hydratase  57.97 
 
 
400 aa  423  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1303  Phosphopyruvate hydratase  48.75 
 
 
401 aa  387  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.50903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  46.94 
 
 
429 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  46.94 
 
 
429 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  46.94 
 
 
429 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0053  phosphopyruvate hydratase  46.8 
 
 
417 aa  343  2e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0387594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  46.6 
 
 
428 aa  330  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  46.36 
 
 
429 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02371  phosphopyruvate hydratase  44.39 
 
 
430 aa  325  7e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0022  enolase  45.5 
 
 
411 aa  325  8.000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  44.31 
 
 
432 aa  325  9e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02261  phosphopyruvate hydratase  42.61 
 
 
430 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.65688  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0210  phosphopyruvate hydratase  43.41 
 
 
430 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  44.61 
 
 
427 aa  323  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  45.48 
 
 
429 aa  324  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  42.61 
 
 
430 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  44.79 
 
 
428 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0197  phosphopyruvate hydratase  43.03 
 
 
413 aa  322  9.999999999999999e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000900243  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  45.34 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  44.99 
 
 
431 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  43.14 
 
 
425 aa  320  3e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  43.77 
 
 
428 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  44.01 
 
 
426 aa  319  5e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  45.1 
 
 
427 aa  319  7e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  43.77 
 
 
426 aa  318  9e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2793  phosphopyruvate hydratase  42.4 
 
 
428 aa  318  9e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  44.23 
 
 
424 aa  318  1e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1098  phosphopyruvate hydratase  44.58 
 
 
417 aa  318  1e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  43.37 
 
 
432 aa  317  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  44.28 
 
 
427 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  44.28 
 
 
428 aa  315  6e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  44.25 
 
 
428 aa  315  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  41.73 
 
 
430 aa  315  7e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  44.9 
 
 
428 aa  315  7e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  43.21 
 
 
429 aa  315  7e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  42.86 
 
 
429 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  43.1 
 
 
427 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  43.63 
 
 
425 aa  315  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0489  phosphopyruvate hydratase  42.75 
 
 
421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  44.04 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  42.96 
 
 
429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  43.93 
 
 
426 aa  313  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  43.28 
 
 
426 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  44.17 
 
 
426 aa  312  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  42.01 
 
 
427 aa  312  7.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  44.04 
 
 
427 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1631  enolase  43.63 
 
 
429 aa  311  9e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  43.8 
 
 
429 aa  311  9e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  41.48 
 
 
430 aa  311  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  44.25 
 
 
427 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02271  phosphopyruvate hydratase  42.09 
 
 
432 aa  311  1e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  43.03 
 
 
426 aa  311  1e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0056  phosphopyruvate hydratase  44.64 
 
 
419 aa  311  1e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  43.88 
 
 
430 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  42.61 
 
 
433 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  41.89 
 
 
430 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  44.77 
 
 
429 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  43.55 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  45.01 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  44.01 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  43.48 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  41.89 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  43.63 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  44.79 
 
 
429 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1575  phosphopyruvate hydratase  42.61 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.837756  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  41.63 
 
 
431 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  44.25 
 
 
427 aa  308  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  44.28 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  44.55 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  41.97 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  44.55 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  43.07 
 
 
427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  44.28 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11041  phosphopyruvate hydratase  45.23 
 
 
429 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.978908  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  43.8 
 
 
427 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1687  phosphopyruvate hydratase  42.26 
 
 
430 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1705  phosphopyruvate hydratase  42.26 
 
 
430 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0347  phosphopyruvate hydratase  41.27 
 
 
437 aa  305  7e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  41.85 
 
 
425 aa  305  7e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  44.53 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  43.38 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  45.12 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2689  phosphopyruvate hydratase  40.66 
 
 
437 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  42.89 
 
 
426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  41.36 
 
 
428 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0277  phosphopyruvate hydratase  40.58 
 
 
430 aa  303  4.0000000000000003e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000069334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0069  enolase  43.87 
 
 
427 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.247834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  39.66 
 
 
425 aa  302  6.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3216  phosphopyruvate hydratase  43.31 
 
 
427 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.308815  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  41.16 
 
 
430 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3486  Phosphopyruvate hydratase  41.67 
 
 
426 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.194771  normal  0.960022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>