More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2379 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2379  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
395 aa  805    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00363465  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2216  phosphopyruvate hydratase  72.91 
 
 
395 aa  579  1e-164  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1238  phosphopyruvate hydratase  69.42 
 
 
399 aa  560  1e-158  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0269963  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1809  phosphopyruvate hydratase  70.89 
 
 
395 aa  561  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2893  phosphopyruvate hydratase  61.06 
 
 
402 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00235502  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2545  enolase  61.36 
 
 
401 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0429  enolase  59.55 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2598  phosphopyruvate hydratase  57.39 
 
 
401 aa  443  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2515  phosphopyruvate hydratase  56.25 
 
 
401 aa  430  1e-119  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1825  phosphopyruvate hydratase  57.97 
 
 
400 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1303  Phosphopyruvate hydratase  51.75 
 
 
401 aa  395  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.50903  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  45.97 
 
 
429 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  45.97 
 
 
429 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  45.97 
 
 
429 aa  344  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0053  phosphopyruvate hydratase  45.02 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0387594 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  45.99 
 
 
428 aa  328  8e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  45.01 
 
 
428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0928  phosphopyruvate hydratase  44.36 
 
 
425 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0201  phosphopyruvate hydratase  45.23 
 
 
428 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0197  phosphopyruvate hydratase  43.53 
 
 
413 aa  324  2e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000900243  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  42.72 
 
 
430 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1036  enolase  45.54 
 
 
430 aa  322  8e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  45.01 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  43.55 
 
 
425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1688  enolase  43.83 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  43.34 
 
 
430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  44.58 
 
 
432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  44.99 
 
 
428 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  44.12 
 
 
427 aa  320  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  44.99 
 
 
429 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  44.12 
 
 
427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  45.04 
 
 
432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2907  phosphopyruvate hydratase  43.31 
 
 
429 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.257877  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  44.04 
 
 
430 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  42.79 
 
 
426 aa  319  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0984  phosphopyruvate hydratase  45.01 
 
 
429 aa  319  6e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07040  enolase  43.28 
 
 
428 aa  318  7.999999999999999e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.723675  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  44.04 
 
 
427 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5816  enolase  44.25 
 
 
426 aa  318  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  44.36 
 
 
427 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  44.69 
 
 
430 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2784  phosphopyruvate hydratase  43.55 
 
 
429 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  43.34 
 
 
430 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4289  phosphopyruvate hydratase  43.8 
 
 
427 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.627493 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  44.99 
 
 
429 aa  317  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02371  phosphopyruvate hydratase  43.6 
 
 
430 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  43.55 
 
 
431 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  41.98 
 
 
430 aa  316  4e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  43.55 
 
 
427 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  43.1 
 
 
431 aa  316  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3012  phosphopyruvate hydratase  43.31 
 
 
429 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.172983 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1098  phosphopyruvate hydratase  42.79 
 
 
417 aa  316  6e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02261  phosphopyruvate hydratase  42.36 
 
 
430 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.65688  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  44.61 
 
 
427 aa  315  7e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  42.89 
 
 
431 aa  315  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  43 
 
 
424 aa  314  9.999999999999999e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2778  phosphopyruvate hydratase  43.31 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6511  phosphopyruvate hydratase  44.77 
 
 
425 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  41.46 
 
 
423 aa  314  9.999999999999999e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0022  enolase  42.5 
 
 
411 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1073  Phosphopyruvate hydratase  44.01 
 
 
431 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  44.5 
 
 
427 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0056  phosphopyruvate hydratase  44.33 
 
 
419 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  44.01 
 
 
427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  43.07 
 
 
427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  42.36 
 
 
430 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  44.61 
 
 
429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02271  phosphopyruvate hydratase  42.44 
 
 
432 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0489  phosphopyruvate hydratase  41.63 
 
 
421 aa  312  6.999999999999999e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  44.04 
 
 
425 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  42.75 
 
 
422 aa  312  7.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  41.98 
 
 
429 aa  311  9e-84  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4471  phosphopyruvate hydratase  42.82 
 
 
427 aa  311  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5894  phosphopyruvate hydratase  44.53 
 
 
425 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  43.13 
 
 
425 aa  311  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  40.88 
 
 
425 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  43.52 
 
 
426 aa  311  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13450  enolase  42.26 
 
 
427 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.786582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  41.73 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  42.27 
 
 
428 aa  310  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0210  phosphopyruvate hydratase  42.36 
 
 
430 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1176  enolase  43.55 
 
 
425 aa  309  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0192586  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04980  phosphopyruvate hydratase  43.38 
 
 
425 aa  309  5e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.686919  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  41.87 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0143  phosphopyruvate hydratase  44.25 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000522536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  44.55 
 
 
429 aa  308  9e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  43.52 
 
 
428 aa  308  9e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  44.04 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  45.04 
 
 
429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0817  phosphopyruvate hydratase  41.97 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1092  phosphopyruvate hydratase  43.55 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.747875  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0801  phosphopyruvate hydratase  41.97 
 
 
434 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0383653  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1132  phosphopyruvate hydratase  43.55 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5019  phosphopyruvate hydratase  44.63 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  44.79 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1220  phosphopyruvate hydratase  42.79 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00017214 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  42.58 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  45.26 
 
 
424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3132  enolase  43.77 
 
 
426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0229642  normal  0.046336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  43.52 
 
 
428 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>