More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0056 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0053  phosphopyruvate hydratase  84.41 
 
 
417 aa  719    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0387594 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0056  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
419 aa  842    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0022  enolase  81.29 
 
 
411 aa  690    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1098  phosphopyruvate hydratase  81.53 
 
 
417 aa  684    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.291269  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0197  phosphopyruvate hydratase  58.05 
 
 
413 aa  481  1e-135  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000900243  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1238  phosphopyruvate hydratase  43.66 
 
 
399 aa  331  1e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0269963  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2379  phosphopyruvate hydratase  44.33 
 
 
395 aa  330  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00363465  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2216  phosphopyruvate hydratase  45.89 
 
 
395 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1303  Phosphopyruvate hydratase  44.09 
 
 
401 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.50903  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0429  enolase  44.17 
 
 
403 aa  318  7.999999999999999e-86  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2598  phosphopyruvate hydratase  44.33 
 
 
401 aa  318  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.181261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1809  phosphopyruvate hydratase  45.57 
 
 
395 aa  316  5e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2515  phosphopyruvate hydratase  44.47 
 
 
401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2545  enolase  44.39 
 
 
401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2893  phosphopyruvate hydratase  43.92 
 
 
402 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00235502  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1825  phosphopyruvate hydratase  44.28 
 
 
400 aa  288  1e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0317  phosphopyruvate hydratase  35.5 
 
 
412 aa  281  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0112  phosphopyruvate hydratase  38.93 
 
 
438 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  37.29 
 
 
427 aa  261  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  37.08 
 
 
425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  37.03 
 
 
429 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  37.21 
 
 
429 aa  258  1e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  37.53 
 
 
429 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  37.53 
 
 
429 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  37.53 
 
 
429 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  39.18 
 
 
428 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0276  phosphopyruvate hydratase  35.95 
 
 
425 aa  257  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000321511  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  36.98 
 
 
429 aa  256  7e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  36.73 
 
 
423 aa  255  9e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  36.34 
 
 
428 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  38.06 
 
 
429 aa  251  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0167  phosphopyruvate hydratase  38.26 
 
 
425 aa  251  1e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  38.06 
 
 
429 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07850  enolase  38 
 
 
426 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.376533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  37.35 
 
 
431 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  37.35 
 
 
431 aa  250  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2793  phosphopyruvate hydratase  36.9 
 
 
428 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  35.51 
 
 
429 aa  250  3e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2145  phosphopyruvate hydratase  38.35 
 
 
424 aa  250  3e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.604241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  37.11 
 
 
427 aa  250  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  36.66 
 
 
431 aa  249  5e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  36.56 
 
 
431 aa  249  5e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  36.84 
 
 
429 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4985  phosphopyruvate hydratase  36.66 
 
 
431 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4814  phosphopyruvate hydratase  36.66 
 
 
431 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5364  phosphopyruvate hydratase  36.66 
 
 
431 aa  249  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0413646  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1668  phosphopyruvate hydratase  36.5 
 
 
416 aa  249  6e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0010021  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  36.66 
 
 
431 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  36.73 
 
 
430 aa  249  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4927  phosphopyruvate hydratase  36.66 
 
 
431 aa  249  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  37.35 
 
 
427 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  38.55 
 
 
424 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  37.32 
 
 
432 aa  246  4e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0494  phosphopyruvate hydratase  37.05 
 
 
424 aa  247  4e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.288428  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3165  enolase  38.16 
 
 
428 aa  246  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0055  enolase  36.95 
 
 
431 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  36.9 
 
 
427 aa  246  6e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2491  phosphopyruvate hydratase  37.65 
 
 
425 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1159  phosphopyruvate hydratase  37.65 
 
 
425 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.582835  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0930  phosphopyruvate hydratase  37.65 
 
 
425 aa  245  9e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0446  enolase  37.77 
 
 
427 aa  245  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261622  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5238  phosphopyruvate hydratase  36.43 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0256572  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5284  phosphopyruvate hydratase  36.43 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000135484  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5703  phosphopyruvate hydratase  36.43 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000699269  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0907  enolase  38.43 
 
 
426 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5249  phosphopyruvate hydratase  36.88 
 
 
431 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.33817  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  36.28 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  37.29 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0671  enolase  38.24 
 
 
428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0775  phosphopyruvate hydratase  36.34 
 
 
432 aa  243  3e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.274671  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1305  phosphopyruvate hydratase  36.57 
 
 
432 aa  243  3e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1924  enolase  37.8 
 
 
430 aa  242  7.999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  38.94 
 
 
427 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  37.38 
 
 
430 aa  241  1e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  37.41 
 
 
425 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  36.45 
 
 
428 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2056  phosphopyruvate hydratase  37.83 
 
 
425 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.743304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  35.39 
 
 
428 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  36.56 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  35.81 
 
 
430 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0890  phosphopyruvate hydratase  36.87 
 
 
427 aa  239  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  36.79 
 
 
427 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  38.57 
 
 
429 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1466  phosphopyruvate hydratase  38.35 
 
 
427 aa  239  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.477629  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4771  phosphopyruvate hydratase  37.29 
 
 
429 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2650  phosphopyruvate hydratase  35.82 
 
 
428 aa  239  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0762745  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1018  enolase  36.19 
 
 
426 aa  239  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.700968  normal  0.0153402 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  37.38 
 
 
430 aa  239  9e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  36.78 
 
 
431 aa  239  9e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  38.33 
 
 
429 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1954  phosphopyruvate hydratase  37.53 
 
 
429 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.419553 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  38.33 
 
 
429 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3923  phosphopyruvate hydratase  38.46 
 
 
427 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273888  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0662  phosphopyruvate hydratase  36.64 
 
 
431 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2816  phosphopyruvate hydratase  35.87 
 
 
427 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.218866  normal  0.507033 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  36.58 
 
 
427 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  36.58 
 
 
427 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  35.61 
 
 
428 aa  238  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1797  phosphopyruvate hydratase  36.77 
 
 
425 aa  237  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.20275  normal  0.528488 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0833  phosphopyruvate hydratase  36.39 
 
 
427 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.539573  normal  0.412801 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>