99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1798 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1798  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
515 aa  1061    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764678  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2534  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  44.1 
 
 
529 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0440745  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3543  hypothetical protein  44.02 
 
 
532 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41750  hypothetical protein  43.82 
 
 
532 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2424  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.7 
 
 
580 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000593134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.8 
 
 
450 aa  77.4  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.94 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.88 
 
 
429 aa  74.3  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.69 
 
 
439 aa  72  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  22.86 
 
 
463 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.64 
 
 
424 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.95 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  21.52 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.65 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1288  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.22 
 
 
565 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.08 
 
 
413 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.88 
 
 
416 aa  64.7  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.28 
 
 
427 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.15 
 
 
432 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.91 
 
 
446 aa  62.8  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.83 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.79 
 
 
400 aa  62  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  21.21 
 
 
482 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0134  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.22 
 
 
471 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.56 
 
 
424 aa  60.8  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  22.16 
 
 
437 aa  60.8  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  23.37 
 
 
424 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  20.9 
 
 
429 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.27 
 
 
437 aa  57  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.44 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.45 
 
 
423 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2203  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.79 
 
 
422 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.92236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.08 
 
 
449 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.08 
 
 
449 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.08 
 
 
449 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  21.67 
 
 
445 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.08 
 
 
449 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.71 
 
 
430 aa  54.7  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.86 
 
 
422 aa  54.7  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.7 
 
 
440 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  20.45 
 
 
421 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.62 
 
 
404 aa  54.3  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.45 
 
 
450 aa  54.3  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312339  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.79 
 
 
429 aa  54.3  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.3 
 
 
428 aa  54.3  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.22 
 
 
421 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.87 
 
 
428 aa  53.5  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0024  toluene transport protein, putative  25.9 
 
 
461 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.137484  normal  0.133309 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.36 
 
 
448 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  22.54 
 
 
438 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  22.07 
 
 
429 aa  52  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.72 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0246  membrane protein  21.22 
 
 
435 aa  52  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2640  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.63 
 
 
446 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.36 
 
 
448 aa  50.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.56 
 
 
412 aa  51.2  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1309  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.63 
 
 
446 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.613202  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  23 
 
 
442 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.08 
 
 
451 aa  50.8  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  20.72 
 
 
424 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.75 
 
 
449 aa  50.1  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  21.89 
 
 
422 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3487  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.32 
 
 
446 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02229  hypothetical protein  22.37 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2495  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.32 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.83 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.47 
 
 
442 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.83 
 
 
435 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1313  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  22.37 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.47 
 
 
364 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2724  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.32 
 
 
446 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19.94 
 
 
426 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02268  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.37 
 
 
448 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.83 
 
 
437 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.67 
 
 
450 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.07 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.37 
 
 
446 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.98 
 
 
432 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0351  outer membrane protein transport protein  20.72 
 
 
407 aa  48.9  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.83 
 
 
437 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.83 
 
 
435 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2330  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.89 
 
 
475 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402524  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  19.35 
 
 
464 aa  48.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  21.8 
 
 
415 aa  47.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.9 
 
 
436 aa  47.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.39 
 
 
450 aa  47.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0907  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.89 
 
 
430 aa  47  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000931505 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.8 
 
 
426 aa  47  0.0009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.67 
 
 
452 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  21.01 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.37 
 
 
415 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.54 
 
 
417 aa  45.8  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  19 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  20.44 
 
 
419 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000778  long-chain fatty acid transport protein  20.39 
 
 
432 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  24.35 
 
 
409 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3553  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.79 
 
 
461 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.34 
 
 
422 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1346  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.17 
 
 
391 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000227507  hitchhiker  0.0000118499 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>