209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1551 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
400 aa  808    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  45.93 
 
 
409 aa  362  6e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  41.14 
 
 
439 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0289  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  45.67 
 
 
401 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.233106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  45.27 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.85 
 
 
416 aa  300  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.2 
 
 
424 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  40.83 
 
 
412 aa  290  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  41.52 
 
 
413 aa  286  5e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  41.73 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  39.49 
 
 
428 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  38.86 
 
 
426 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1000  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  35.78 
 
 
402 aa  246  6e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.768268  hitchhiker  0.00646641 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0907  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  33.82 
 
 
430 aa  240  4e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000931505 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1710  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  34.55 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.22 
 
 
419 aa  189  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.12 
 
 
410 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.31 
 
 
420 aa  160  4e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  30.12 
 
 
424 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  30 
 
 
423 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  29.45 
 
 
422 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  27.94 
 
 
424 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  29.16 
 
 
429 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.5 
 
 
427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  32.97 
 
 
400 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.77 
 
 
453 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.74 
 
 
422 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.27 
 
 
424 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.06 
 
 
450 aa  149  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.85 
 
 
421 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.09 
 
 
421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.69 
 
 
458 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  29.26 
 
 
432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.09 
 
 
421 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  29.89 
 
 
417 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.32 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.37 
 
 
406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.41 
 
 
432 aa  140  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.02 
 
 
442 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  27.03 
 
 
407 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.64 
 
 
450 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0135  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  29.37 
 
 
405 aa  137  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  30.47 
 
 
419 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.96 
 
 
423 aa  136  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.57 
 
 
428 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  29.91 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  26.94 
 
 
445 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.74 
 
 
426 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002852  long-chain fatty acid transport protein  29.32 
 
 
419 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  27.44 
 
 
437 aa  127  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2269  outer membrane protein transport protein  29.71 
 
 
415 aa  125  9e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00153589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.82 
 
 
415 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.79 
 
 
415 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03124  hypothetical protein  28.4 
 
 
420 aa  121  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.93 
 
 
442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.31 
 
 
422 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  23.61 
 
 
464 aa  118  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.98 
 
 
429 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  27.45 
 
 
412 aa  116  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.1 
 
 
450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0561  long-chain fatty acid transport protein  26.24 
 
 
428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.34 
 
 
430 aa  114  3e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0328  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.43 
 
 
447 aa  113  5e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.05 
 
 
417 aa  112  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  25.53 
 
 
414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.84 
 
 
459 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.53 
 
 
420 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  25.42 
 
 
414 aa  111  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  24.81 
 
 
442 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.27 
 
 
364 aa  110  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.72 
 
 
449 aa  110  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.95 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.62 
 
 
432 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.78 
 
 
421 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1834  hypothetical protein  25.59 
 
 
413 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0420265  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.48 
 
 
427 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.78 
 
 
421 aa  107  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.78 
 
 
421 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3634  long-chain fatty acid transport protein  26.67 
 
 
428 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000535062  hitchhiker  0.00000860939 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.46 
 
 
437 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.42 
 
 
488 aa  106  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.86 
 
 
429 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  25.83 
 
 
429 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.29 
 
 
448 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04350  outer membrane protein P1, putative  26.51 
 
 
415 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0256286  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.78 
 
 
450 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.29 
 
 
448 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.74 
 
 
449 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.74 
 
 
449 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.74 
 
 
449 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.74 
 
 
449 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.55 
 
 
444 aa  103  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.48 
 
 
449 aa  103  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.42 
 
 
430 aa  103  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2687  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.02 
 
 
427 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000955558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.88 
 
 
452 aa  102  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 
445 aa  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000167182  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03551  outer membrane protein  23.76 
 
 
446 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.06 
 
 
430 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2436  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.72 
 
 
438 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000365967  hitchhiker  0.00491561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>