53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3553 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3553  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 		 461 aa  920    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.0101519 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.72 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2250  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.25 
 
 		 407 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.79 
 
 		 439 aa  90.1  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  25.36 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.7 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0289  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.45 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.233106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.94 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1710  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.4 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.51 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.7 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.94 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.54 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2534  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.24 
 
 		 529 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0440745  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.88 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  30.71 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.55 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.3 
 
 		 400 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.33 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.72 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.7 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0907  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.43 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000931505 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0428  OMPP1/FadL/TodX family toluene transport protein  23.98 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000260266  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0135  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.22 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04350  outer membrane protein P1, putative  22.71 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0256286  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  24.71 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  21.18 
 
 		 407 aa  53.9  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41750  hypothetical protein  20.21 
 
 		 532 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.7 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  22.89 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  22.03 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4111  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.41 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129657  normal  0.252995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3543  hypothetical protein  19.79 
 
 		 532 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311646  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1000  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.71 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.768268  hitchhiker  0.00646641 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.3 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  21.49 
 
 		 424 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0134  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.77 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512951  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  22.46 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.22 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2330  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.89 
 
 		 475 aa  47.8  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.64 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.89 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0032  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.59 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.85 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  22.66 
 
 		 417 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.49 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.12 
 
 		 364 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.45 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3558  Outer membrane protein (CymD)  25.26 
 
 		 460 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239673  normal  0.823203 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1798  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.93 
 
 		 515 aa  44.3  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.764678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.74 
 
 		 430 aa  43.1  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  20.35 
 
 		 423 aa  43.1  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>