191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1252 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  100 
 
 
446 aa  899    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  31.98 
 
 
430 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  31.66 
 
 
429 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  28.61 
 
 
405 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.62 
 
 
450 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.91 
 
 
415 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.63 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.85 
 
 
450 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  28.11 
 
 
401 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60730  putative outer membrane protein  25.97 
 
 
463 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  28.22 
 
 
442 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.66 
 
 
450 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.87 
 
 
437 aa  137  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2562  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.1 
 
 
429 aa  136  6.0000000000000005e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000928224  hitchhiker  0.000000000130731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.94 
 
 
423 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.57 
 
 
400 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5229  outer membrane protein  24.9 
 
 
482 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  27.19 
 
 
420 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.06 
 
 
426 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.11 
 
 
364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  27.18 
 
 
424 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4441  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.17 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00526852 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.16 
 
 
442 aa  127  5e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.32 
 
 
459 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  25.32 
 
 
429 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.54 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  24.63 
 
 
424 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.45 
 
 
427 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.19 
 
 
421 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.03 
 
 
450 aa  117  6e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2824  long-chain fatty acid outer membrane transporter  26.78 
 
 
427 aa  116  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  26.22 
 
 
442 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  24.89 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.97 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.54 
 
 
436 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0328  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.69 
 
 
447 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  24.31 
 
 
432 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  25.3 
 
 
424 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.29 
 
 
421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.75 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  25.32 
 
 
445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  25.45 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2013  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  25.12 
 
 
432 aa  111  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.06 
 
 
417 aa  111  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03551  outer membrane protein  24.09 
 
 
446 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4491  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.98 
 
 
441 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4009  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.76 
 
 
441 aa  107  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.94 
 
 
430 aa  107  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.53 
 
 
420 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4378  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.48 
 
 
441 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335616  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5803  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.51 
 
 
432 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1774  hypothetical protein  25.06 
 
 
480 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6026  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.65 
 
 
431 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.83 
 
 
439 aa  106  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.62 
 
 
428 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  23.82 
 
 
437 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0306  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.12 
 
 
449 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.99 
 
 
416 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  23.11 
 
 
438 aa  104  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.85 
 
 
430 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.53 
 
 
432 aa  103  7e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.38 
 
 
421 aa  103  8e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  23.35 
 
 
453 aa  102  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  22.93 
 
 
464 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.13 
 
 
421 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.13 
 
 
421 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2884  long-chain fatty acid outer membrane transporter  24.52 
 
 
444 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.576882  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.54 
 
 
404 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  26 
 
 
409 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2745  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.71 
 
 
435 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00852795  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2634  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.71 
 
 
437 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0127967  hitchhiker  0.00000000000285546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2580  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.71 
 
 
435 aa  99.8  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00696507  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3381  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25 
 
 
440 aa  99.8  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0134  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.11 
 
 
471 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.512951  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2531  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.71 
 
 
435 aa  99.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876174  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2620  long-chain fatty acid outer membrane transporter  25.48 
 
 
437 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0208452  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.93 
 
 
413 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1773  hypothetical protein  25 
 
 
478 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  23.54 
 
 
414 aa  97.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.95 
 
 
428 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0351  outer membrane protein transport protein  26.44 
 
 
407 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  23.1 
 
 
407 aa  94.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  22.76 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.86 
 
 
401 aa  94.4  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.46 
 
 
424 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  23.9 
 
 
419 aa  94  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.11 
 
 
419 aa  93.6  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.87 
 
 
488 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3793  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.9 
 
 
436 aa  92.4  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  22.43 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02268  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.65 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02229  hypothetical protein  23.65 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1313  membrane protein involved in aromatic hydrocarbon degradation  23.65 
 
 
446 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2687  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.37 
 
 
427 aa  90.5  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000955558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1309  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.65 
 
 
446 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.613202  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2724  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.65 
 
 
446 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2640  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.65 
 
 
446 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.45 
 
 
410 aa  90.1  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2503  long-chain fatty acid outer membrane transporter  24.26 
 
 
446 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2495  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.65 
 
 
446 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>