36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6185 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  85.29 
 
 
170 aa  263  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  62.05 
 
 
168 aa  214  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  59.15 
 
 
177 aa  207  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  73.37 
 
 
170 aa  205  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  64.5 
 
 
170 aa  204  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  64.5 
 
 
170 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  63.31 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  56.21 
 
 
170 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  50.9 
 
 
168 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  51.48 
 
 
176 aa  157  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  52.69 
 
 
168 aa  157  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  52.98 
 
 
168 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  51.79 
 
 
168 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  52.38 
 
 
168 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  49.7 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  44.58 
 
 
182 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  48.24 
 
 
178 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  51.76 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  51.76 
 
 
169 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  48.24 
 
 
176 aa  132  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  47.65 
 
 
176 aa  131  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  46.67 
 
 
178 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  44.31 
 
 
170 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  40.72 
 
 
197 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  37.5 
 
 
192 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
191 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 
191 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  29.49 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
189 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  27.85 
 
 
192 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  29.45 
 
 
183 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  35.78 
 
 
191 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2373  protein-tyrosine phosphatase  32.97 
 
 
438 aa  43.9  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.191988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>