36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1011 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  100 
 
 
176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  92.05 
 
 
176 aa  303  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  70 
 
 
178 aa  234  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  70.35 
 
 
178 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  44.64 
 
 
168 aa  144  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  47.65 
 
 
176 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  44.05 
 
 
177 aa  140  8e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  44.71 
 
 
170 aa  131  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  131  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  50 
 
 
169 aa  131  6e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  42.01 
 
 
170 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  43.53 
 
 
170 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  43.53 
 
 
170 aa  125  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  40 
 
 
170 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  45.29 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  48.24 
 
 
170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  42.77 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  45.29 
 
 
170 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  38.41 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  33.54 
 
 
168 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  37.41 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  36.05 
 
 
168 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  36.3 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  36.99 
 
 
168 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  37.17 
 
 
194 aa  63.5  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  38.02 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  43.64 
 
 
191 aa  61.2  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  35.54 
 
 
192 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  33.11 
 
 
191 aa  57.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 
191 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
192 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4148  protein tyrosine phosphatase-like protein  39.45 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00974385  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  35.4 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>