36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1163 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  100 
 
 
176 aa  349  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  92.05 
 
 
176 aa  304  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  70 
 
 
178 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  66.47 
 
 
178 aa  225  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  44.97 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  47.37 
 
 
176 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  50.58 
 
 
169 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  50.58 
 
 
169 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  44.71 
 
 
170 aa  131  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  44.12 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  44.71 
 
 
170 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  41.18 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  42.26 
 
 
170 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  43.98 
 
 
197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  37.43 
 
 
182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  47.65 
 
 
170 aa  115  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  45.29 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  44.71 
 
 
170 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  38.41 
 
 
168 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  34.15 
 
 
168 aa  105  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  37.41 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  36.3 
 
 
168 aa  96.3  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  34.69 
 
 
168 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  34.93 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  39.1 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  38.14 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  37.19 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  35.54 
 
 
192 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  38.36 
 
 
191 aa  58.9  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  35 
 
 
191 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  32.43 
 
 
191 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  37.61 
 
 
192 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4148  protein tyrosine phosphatase-like protein  39.45 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00974385  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  36.28 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>