36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1234 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  337  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  88.69 
 
 		 168 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  83.33 
 
 		 168 aa  263  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  81.55 
 
 		 168 aa  261  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  74.4 
 
 		 168 aa  261  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  75 
 
 		 168 aa  237  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  52.73 
 
 		 168 aa  180  9.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  47.59 
 
 		 177 aa  167  4e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  48.19 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  48.5 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  49.1 
 
 		 170 aa  151  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  44.31 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  53.61 
 
 		 170 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  50.9 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  45.18 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  49.7 
 
 		 170 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  39.63 
 
 		 176 aa  124  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  40.96 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  40.72 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  40.72 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  39.75 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  39.46 
 
 		 178 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  37.06 
 
 		 197 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  36.05 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  34.69 
 
 		 176 aa  92.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  34.42 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  35.26 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  32.26 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  31.33 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  28.57 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  34.58 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  32.69 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  37.78 
 
 		 161 aa  44.3  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  28.03 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>