35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6704 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  340  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  85.29 
 
 		 170 aa  255  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  60.84 
 
 		 168 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  57.93 
 
 		 177 aa  204  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  70.41 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  61.54 
 
 		 170 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  62.13 
 
 		 170 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  60.95 
 
 		 170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  56.8 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  53.89 
 
 		 168 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  48.5 
 
 		 168 aa  163  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  52.98 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  52.98 
 
 		 168 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  49.7 
 
 		 176 aa  152  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  50.9 
 
 		 168 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  50.6 
 
 		 168 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  45.78 
 
 		 182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  47.06 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  50.59 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  50.59 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  45.29 
 
 		 176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  44.12 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  44.71 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  43.71 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  39.05 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  36.67 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  34.62 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  33.97 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  33.97 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  37.61 
 
 		 191 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  27.81 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>