35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2744 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  100 
 
 
170 aa  335  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  50.6 
 
 
176 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  50.3 
 
 
182 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  48.5 
 
 
169 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  48.5 
 
 
169 aa  139  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  42.42 
 
 
168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  49.7 
 
 
170 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  49.09 
 
 
170 aa  129  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  45.51 
 
 
177 aa  128  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  49.4 
 
 
170 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  42.01 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  49.11 
 
 
170 aa  115  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  45.34 
 
 
197 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  42.42 
 
 
168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  40.96 
 
 
168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  42.26 
 
 
176 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  43.62 
 
 
168 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  39.16 
 
 
168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  43.33 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  39.88 
 
 
178 aa  107  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  38.79 
 
 
168 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  38.1 
 
 
178 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  44.24 
 
 
170 aa  97.4  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  44.85 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
189 aa  87.4  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  34.52 
 
 
194 aa  79  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  34.72 
 
 
192 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  35.17 
 
 
192 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  33.77 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  33.54 
 
 
192 aa  61.6  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  38.1 
 
 
191 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  30.41 
 
 
183 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>