38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0665 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  339  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  339  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  70.24 
 
 
176 aa  243  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  53.8 
 
 
168 aa  166  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  52.94 
 
 
170 aa  151  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  52.35 
 
 
170 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  48.5 
 
 
170 aa  148  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  50.59 
 
 
170 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  44.91 
 
 
182 aa  137  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  47.31 
 
 
177 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  50 
 
 
176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  50 
 
 
176 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  53.29 
 
 
170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  49.1 
 
 
170 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  50.59 
 
 
170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  40.35 
 
 
168 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  48.82 
 
 
178 aa  124  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  46.47 
 
 
178 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  51.76 
 
 
170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  45.12 
 
 
197 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  44.44 
 
 
168 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  41.32 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  40.72 
 
 
168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  41.52 
 
 
168 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  40.12 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 
192 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  41.22 
 
 
189 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  39.26 
 
 
192 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  32.32 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  35.07 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 
191 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  34.56 
 
 
192 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  33.98 
 
 
183 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  34.26 
 
 
191 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3931  Thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
107 aa  43.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4128  Thiosulfate sulfurtransferase  40 
 
 
107 aa  41.6  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.801099  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0289  Thiosulfate sulfurtransferase  42.55 
 
 
106 aa  41.2  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>