36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1460 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  70 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  67.25 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  66.47 
 
 		 176 aa  224  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  44.64 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  44.85 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  45.83 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  43.5 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  47.06 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  48.24 
 
 		 170 aa  128  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  48.82 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  48.82 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  42.77 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  45.24 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  41.61 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  39.75 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  42.86 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  40.94 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  41.67 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  39.75 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  42.17 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  39.88 
 
 		 170 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  39.13 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  38.51 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  39.04 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  37.04 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  42.2 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  33.58 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  38.94 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  35.09 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  32.14 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  34.02 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  31.96 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  31.96 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  31.75 
 
 		 183 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4148  protein tyrosine phosphatase-like protein  38.1 
 
 		 185 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00974385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>