37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1113 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  342  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  88.69 
 
 		 168 aa  288  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  85.12 
 
 		 168 aa  271  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  83.33 
 
 		 168 aa  265  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  76.19 
 
 		 168 aa  263  8.999999999999999e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  76.19 
 
 		 168 aa  243  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  53.94 
 
 		 168 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  48.8 
 
 		 177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  50.6 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  50.9 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  51.5 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  154  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  55.69 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  52.98 
 
 		 170 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  43.71 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  51.79 
 
 		 170 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  40.12 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  40.96 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  41.32 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  41.32 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  39.46 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  39.13 
 
 		 178 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  36.99 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  36.3 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  33.73 
 
 		 197 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  33.12 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  30.67 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  32.52 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  31.9 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  27.27 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  33.33 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  30.13 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  29.75 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  29.69 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  30.15 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4148  protein tyrosine phosphatase-like protein  33.09 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00974385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>