36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6360 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  88.02 
 
 		 192 aa  339  2e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  64.92 
 
 		 191 aa  240  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  64.92 
 
 		 191 aa  240  7e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  65.79 
 
 		 189 aa  232  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  61.78 
 
 		 191 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  52.72 
 
 		 194 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  54.4 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  43.22 
 
 		 176 aa  96.3  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  41.48 
 
 		 169 aa  87.8  9e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  41.48 
 
 		 169 aa  87.8  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  37.33 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  37.5 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  37.58 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  36.62 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  34.42 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  34 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  34.72 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  37.84 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  32.68 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  35.03 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  31.82 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  30.67 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  31.06 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  32.26 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  32 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  37.19 
 
 		 176 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  35.46 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  38.02 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  33.58 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  32.24 
 
 		 168 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  29.61 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  32.06 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  30.63 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  29.81 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4148  protein tyrosine phosphatase-like protein  36.36 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00974385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>