35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5268 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 192 aa  396  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  66.84 
 
 		 194 aa  265  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  54.4 
 
 		 192 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  51.65 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  49.73 
 
 		 191 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  49.19 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  49.19 
 
 		 191 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  49.73 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  33.12 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  34.42 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  32.08 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  33.99 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  29.3 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  32.24 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  33.54 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  32.24 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  30 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  34.31 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  34.31 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  35.4 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  34.51 
 
 		 168 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  40.71 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  38.94 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  32.03 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  37.61 
 
 		 176 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  31.36 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  29.11 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  36.11 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  31.01 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  32.62 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  37.61 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  35.11 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  27.92 
 
 		 170 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  36.71 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>