35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3765 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 
189 aa  368  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  65.62 
 
 
192 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  66.14 
 
 
191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  66.14 
 
 
191 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  65.79 
 
 
192 aa  232  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  64.02 
 
 
191 aa  231  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 
194 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  49.73 
 
 
192 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  39.86 
 
 
170 aa  87.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  36.81 
 
 
176 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  41.22 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  41.22 
 
 
169 aa  85.5  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  39.26 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  34.44 
 
 
170 aa  73.2  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  33.76 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  37.96 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  39.1 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  33.91 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  38.71 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  30.67 
 
 
168 aa  68.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  39.1 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  34.48 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  30.41 
 
 
168 aa  67.4  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  36.18 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  34.75 
 
 
170 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  31.33 
 
 
168 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  29.01 
 
 
168 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  37.04 
 
 
178 aa  59.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  32.41 
 
 
168 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  32.64 
 
 
170 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  29.92 
 
 
168 aa  57.8  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  27.46 
 
 
168 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  33.11 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  32.03 
 
 
197 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  31.85 
 
 
183 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>