36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3990 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  67.06 
 
 		 170 aa  218  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  67.65 
 
 		 170 aa  214  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  67.65 
 
 		 170 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  70.41 
 
 		 170 aa  207  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  60.37 
 
 		 168 aa  204  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  57.58 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  73.37 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  56.8 
 
 		 170 aa  185  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  57.23 
 
 		 168 aa  167  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  55.69 
 
 		 168 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  55.09 
 
 		 168 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  49.4 
 
 		 168 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  53.61 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  53.89 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  50.3 
 
 		 176 aa  153  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  49.4 
 
 		 170 aa  145  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  53.29 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  53.29 
 
 		 169 aa  137  7e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  46.47 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  42.17 
 
 		 182 aa  131  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  45.24 
 
 		 178 aa  131  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  45.03 
 
 		 176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  44.71 
 
 		 176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  41.42 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  37.58 
 
 		 192 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  38.71 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  36.08 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  31.4 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  32.08 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  32.52 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  31.45 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  37.38 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  34.85 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  34.57 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>