35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0704 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  358  3e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  70.35 
 
 		 176 aa  228  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  70 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  67.25 
 
 		 178 aa  224  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  41.67 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  41.92 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  45.29 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  42.37 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  46.47 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  43.53 
 
 		 170 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  40.59 
 
 		 170 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  42.94 
 
 		 170 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  46.47 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  46.47 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  37.42 
 
 		 168 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  40.49 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  44.64 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  46.43 
 
 		 170 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  42.26 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  40.56 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  39.46 
 
 		 168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  38.1 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  37.13 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  39.46 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  38.1 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  35.03 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  37.96 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  41.41 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  37.76 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  30.83 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  37.19 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4148  protein tyrosine phosphatase-like protein  34.75 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00974385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>