35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4307 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  98.24 
 
 		 170 aa  332  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  88.82 
 
 		 170 aa  292  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  67.65 
 
 		 170 aa  202  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  56.02 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  54.55 
 
 		 168 aa  191  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  62.13 
 
 		 170 aa  190  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  64.5 
 
 		 170 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  53.29 
 
 		 168 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  52.07 
 
 		 170 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  50.29 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  46.71 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  51.5 
 
 		 168 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  50.3 
 
 		 168 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  49.1 
 
 		 168 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  49.1 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  46.11 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  52.94 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  52.94 
 
 		 169 aa  150  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  49.7 
 
 		 170 aa  140  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  44.71 
 
 		 176 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  43.53 
 
 		 176 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  43.53 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  42.86 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  40.83 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  37.33 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  34.48 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  41.9 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  29.11 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  30.16 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  30.87 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  30.87 
 
 		 191 aa  51.2  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  29.53 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  36.45 
 
 		 191 aa  44.7  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>