35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3284 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  45.34 
 
 		 170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  41.67 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  41.11 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  43.98 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1460  hypothetical protein  42.17 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  45.31 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  45.12 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  45.12 
 
 		 169 aa  104  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  38.32 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1011  putative tyrosine phosphatase protein  42.77 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.947369  normal  0.809645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0704  hypothetical protein  42.26 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.200895  normal  0.482202 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  44.53 
 
 		 170 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  37.88 
 
 		 168 aa  92  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  40.83 
 
 		 170 aa  92  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  44.96 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  38.78 
 
 		 168 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1234  hypothetical protein  36.69 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  39.05 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1103  hypothetical protein  41.32 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  35.5 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  33.73 
 
 		 168 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3990  hypothetical protein  41.42 
 
 		 170 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0519788  hitchhiker  0.00883743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  37.12 
 
 		 168 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  40.72 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  31.91 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5268  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  32.06 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  32.03 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  36.45 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  30.3 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2533  protein tyrosine phosphatase  33.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2756  protein tyrosine phosphatase  33.91 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.910127  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2461  protein tyrosine phosphatase  33.04 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0610948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  29.17 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>