27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0583 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0583  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0595  protein tyrosine phosphatase-like protein  33.55 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.697781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2624  hypothetical protein  31.76 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4824  hypothetical protein  28.46 
 
 		 170 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2370  hypothetical protein  30.53 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.561031  normal  0.15146 
 
 
-
 
NC_004310  BR0665  hypothetical protein  33.01 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0657  hypothetical protein  33.01 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.571115  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3284  hypothetical protein  29.17 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1173  hypothetical protein  32.8 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.380907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4162  protein tyrosine phosphatase  40.28 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1474  hypothetical protein  29.6 
 
 		 168 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4307  hypothetical protein  30.16 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.816214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6185  hypothetical protein  28.97 
 
 		 170 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6360  protein tyrosine phosphatase  30.63 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6704  hypothetical protein  28.28 
 
 		 170 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4148  protein tyrosine phosphatase-like protein  35.92 
 
 		 185 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00974385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0737  hypothetical protein  28.35 
 
 		 182 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.987787  normal  0.752042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2744  hypothetical protein  30.41 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.093616 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4022  hypothetical protein  28.12 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1252  hypothetical protein  27.56 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.437365  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4676  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.779368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1113  hypothetical protein  29.13 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0912478  normal  0.304754 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7132  protein tyrosine phosphatase  31.65 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_7942  predicted protein  29.27 
 
 		 161 aa  45.1  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3765  protein tyrosine phosphatase  31.85 
 
 		 189 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1163  putative tyrosine phosphatase protein  34.82 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4334  hypothetical protein  25.98 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>