44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3987 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3987  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 519 aa  1021    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.181654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0683  glycosyl transferase, group 1  30.2 
 
 		 482 aa  117  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0144645  normal  0.0442463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1212  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360145  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  28.32 
 
 		 1261 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0218  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.031233  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 1915 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  28.8 
 
 		 1241 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0106  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 469 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.341014  normal  0.913948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00740  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 787 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.456388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2941  glycosyl transferase, group 1  29.38 
 
 		 1243 aa  96.7  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  27.15 
 
 		 1089 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 		 1241 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 1028 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  24.82 
 
 		 1398 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0492  mannosyltransferase A  22.65 
 
 		 743 aa  73.6  0.000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.700737  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4283  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 		 1229 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3844  hypothetical protein  25.12 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.429225 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0135  hypothetical protein  25.38 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0528  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.19 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.81282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2178  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.19 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.336694  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3282  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.19 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.741817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3247  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.19 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1071  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.19 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.108394  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3296  WcbH  23.19 
 
 		 598 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0341836  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2300  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.19 
 
 		 598 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.878299  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2582  glycosyl transferase group 1  24.74 
 
 		 1332 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.35538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  23.39 
 
 		 384 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5161  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 		 747 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.510872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 380 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0865  glycosyl transferase, group 1  23.44 
 
 		 763 aa  48.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.926448  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 		 478 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.5 
 
 		 385 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2643  endo-1,4-beta-xylanase  23.14 
 
 		 770 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.739332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  24.82 
 
 		 388 aa  47.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 		 370 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2577  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 		 767 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  23.11 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 		 421 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1527  glycosyl transferase, group 1  24.26 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.161562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  25.14 
 
 		 382 aa  44.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 422 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1363  glycosyl transferase group 1  25.21 
 
 		 774 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.744845  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0890  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 		 435 aa  43.9  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.102744  decreased coverage  0.000533539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>