44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1557 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 444 aa  910    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  52.15 
 
 		 442 aa  478  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  43.41 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  39.25 
 
 		 446 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  41.11 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  40.99 
 
 		 438 aa  348  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  41.12 
 
 		 437 aa  345  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  40 
 
 		 443 aa  343  5e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  41.13 
 
 		 445 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  39.25 
 
 		 443 aa  338  8e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  39.77 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  39.68 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  38.94 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  39.4 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  38.05 
 
 		 431 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  38.71 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  39.6 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  41.73 
 
 		 434 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  38.39 
 
 		 433 aa  320  3e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  38.86 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  37.16 
 
 		 423 aa  316  6e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  39.11 
 
 		 449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  35.87 
 
 		 443 aa  296  4e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  35.2 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  29.87 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  26.79 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  27.08 
 
 		 441 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  28.93 
 
 		 430 aa  132  9e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  23.63 
 
 		 435 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  26.16 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  26.38 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  24.15 
 
 		 444 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  25.48 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  21.56 
 
 		 436 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  25.49 
 
 		 450 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  23.93 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  22.62 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  21.67 
 
 		 442 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  23.32 
 
 		 441 aa  95.1  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  22.3 
 
 		 464 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  25.47 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  20.16 
 
 		 407 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 998 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3939  hypothetical protein  25.99 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>