43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4278 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 436 aa  858    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  62.53 
 
 		 440 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  59.27 
 
 		 441 aa  502  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  59.53 
 
 		 464 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  58.82 
 
 		 442 aa  488  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  54.94 
 
 		 424 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  51.48 
 
 		 441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  39.52 
 
 		 435 aa  280  5e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  38.86 
 
 		 435 aa  277  3e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  38.25 
 
 		 430 aa  260  4e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  38.39 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  38.29 
 
 		 441 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  37.27 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  37.33 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  36.55 
 
 		 450 aa  236  7e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  21.56 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  23.81 
 
 		 443 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  25.35 
 
 		 442 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  21.61 
 
 		 442 aa  100  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  27.97 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  27.17 
 
 		 431 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  25.81 
 
 		 445 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  28.65 
 
 		 413 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  26.26 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  26.4 
 
 		 431 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  26.92 
 
 		 446 aa  92.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  27.4 
 
 		 436 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  23.53 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  22.46 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  25.28 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  22.5 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  23.94 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  22.76 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  23.77 
 
 		 449 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  23.49 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  24.52 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  22.93 
 
 		 434 aa  79.7  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  20.92 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  21.63 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  22.95 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  30.36 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  24.65 
 
 		 406 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2928  ATP-dependent protease La  26.48 
 
 		 760 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0257746  normal  0.350775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>