43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3425 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  879    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  90.49 
 
 		 431 aa  810    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  71.9 
 
 		 449 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  72.81 
 
 		 445 aa  678    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  78.65 
 
 		 432 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  76.39 
 
 		 434 aa  698    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  94.9 
 
 		 431 aa  842    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  78.85 
 
 		 436 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  67.26 
 
 		 448 aa  631  1e-180  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  64.76 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  61.95 
 
 		 434 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  63.03 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  60.46 
 
 		 443 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  61.36 
 
 		 423 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  53.92 
 
 		 443 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  53.97 
 
 		 446 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  44.24 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  39.4 
 
 		 444 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  38.43 
 
 		 438 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  37.59 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  40.74 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  37.95 
 
 		 443 aa  306  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  43.87 
 
 		 406 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  35.06 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  33.49 
 
 		 441 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  26.7 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  25.94 
 
 		 424 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  24.03 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  29.05 
 
 		 440 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  25.78 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  25.37 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  27.17 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  24.64 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  25.12 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  24.81 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  24.79 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  23.83 
 
 		 440 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  23.92 
 
 		 450 aa  87.4  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  26.1 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  26.3 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  25.66 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3939  hypothetical protein  30.94 
 
 		 448 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1769  hypothetical protein  33.87 
 
 		 330 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>