42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3078 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 440 aa  895    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  69.79 
 
 		 450 aa  614  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  70.12 
 
 		 450 aa  592  1e-168  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  67.28 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  36.13 
 
 		 424 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  37.27 
 
 		 436 aa  245  9.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  33.74 
 
 		 441 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  34.3 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  34.75 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  33.18 
 
 		 442 aa  229  6e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  34.21 
 
 		 435 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  35.2 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  33.56 
 
 		 444 aa  221  9.999999999999999e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  33.49 
 
 		 435 aa  220  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  33.1 
 
 		 441 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  27.17 
 
 		 443 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  26.38 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  25.89 
 
 		 442 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  25.24 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  26.37 
 
 		 446 aa  103  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  24.63 
 
 		 441 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  24.01 
 
 		 443 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  24.94 
 
 		 432 aa  96.3  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  24.69 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  24.69 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  25.85 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  23.95 
 
 		 431 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  22.72 
 
 		 443 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  23.83 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  24.39 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  23.95 
 
 		 431 aa  87  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  22.3 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  25.38 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  22.71 
 
 		 448 aa  82.4  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  23.39 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  23.73 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  22.38 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  23.08 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  24.06 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  23.15 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  23.67 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  24.27 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>