43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0963 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  913    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  57.79 
 
 		 442 aa  534  1e-150  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  52.15 
 
 		 444 aa  478  1e-133  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  45.37 
 
 		 443 aa  388  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  43.81 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  44.04 
 
 		 423 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  44.24 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  41.4 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  41.98 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  42.99 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  43.18 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  43.12 
 
 		 431 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  43.5 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  43.16 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  42.89 
 
 		 448 aa  362  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  42.24 
 
 		 434 aa  360  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  42.44 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  42.79 
 
 		 441 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  43.03 
 
 		 449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  42.26 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  40.28 
 
 		 438 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  40.24 
 
 		 433 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  35.86 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  36.54 
 
 		 441 aa  295  9e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  33.25 
 
 		 406 aa  216  8e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  24.36 
 
 		 435 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  25.37 
 
 		 435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  24.75 
 
 		 430 aa  126  7e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  27.79 
 
 		 450 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  25.81 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  27.23 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  27.54 
 
 		 450 aa  113  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  25.89 
 
 		 440 aa  113  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  24.2 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  26.54 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  24.5 
 
 		 442 aa  108  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  24.26 
 
 		 424 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  21.61 
 
 		 436 aa  100  5e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  23.24 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  21.17 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1768  hypothetical protein  22.75 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  22.02 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4197  transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 998 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>